2013~2014年上饶市甲1亚型流感病毒HA1基因特性的分析(2)
1.5 引物和核苷酸序列测定
引物1:5′-AGCAAAAGCAGGGGAAAATAAAA-CC-3′;引物2:5′-CAATGAAACCGGCAATGGCTCC-3′[5]。引物由上海生物工程技术服务有限公司合成,PCR产物序列测定送上海生物工程技术服务有限公司。
1.6 基因序列分析
氨基酸和核苷酸分析采用DNAStar 5.0、Mage 4.0序列分析软件,将WHO北半球新型甲型H1N1流感疫苗推荐株A/California/07/2009(H1N1)的HA1基因序列作为参比分析。
2 结果
2.1 2013~2014年上饶市流感病毒的分离情况
2013~2014年共分离鉴定流感病例样本2273件,分离到甲1亚型流感病毒47株。其中2013年分离鉴定流感病例样本1204件,分离到甲1亚型流感病毒26株;2014年分离鉴定流感病例样本1069件,分离到甲1亚型流感病毒21株。
2.2 氨基酸和核苷酸序列的分析结果
随机抽取10株甲1亚型流感病毒进行HA1区核苷酸序列检测,选2013年分离的毒株4株,2014年分离的毒株6株。对HA1基因PCR产物经核苷酸序列测定、序列拼接后 ......
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引物1:5′-AGCAAAAGCAGGGGAAAATAAAA-CC-3′;引物2:5′-CAATGAAACCGGCAATGGCTCC-3′[5]。引物由上海生物工程技术服务有限公司合成,PCR产物序列测定送上海生物工程技术服务有限公司。
1.6 基因序列分析
氨基酸和核苷酸分析采用DNAStar 5.0、Mage 4.0序列分析软件,将WHO北半球新型甲型H1N1流感疫苗推荐株A/California/07/2009(H1N1)的HA1基因序列作为参比分析。
2 结果
2.1 2013~2014年上饶市流感病毒的分离情况
2013~2014年共分离鉴定流感病例样本2273件,分离到甲1亚型流感病毒47株。其中2013年分离鉴定流感病例样本1204件,分离到甲1亚型流感病毒26株;2014年分离鉴定流感病例样本1069件,分离到甲1亚型流感病毒21株。
2.2 氨基酸和核苷酸序列的分析结果
随机抽取10株甲1亚型流感病毒进行HA1区核苷酸序列检测,选2013年分离的毒株4株,2014年分离的毒株6株。对HA1基因PCR产物经核苷酸序列测定、序列拼接后 ......
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